港鐵
1980's 東區海底隧道
一九八四年，政府建議興建第二條過海隧道─東區海底隧道。當時承建商建議興建一條供車輛及地鐵使用的隧道，故此地鐵東隧部份便由此而來。
地鐵的東隧部份，把觀塘綫延長至鰂魚涌，並且增加了藍田站，鰂魚涌作為與港島綫的轉車站。
一九八五年十二月，東區海底隧道及藍田站動工興建，並於一九八九年八月六日啟用。
1990's 機場鐵路
機場鐵路是屬於機場核心計劃的一個重要部份，它把為於赤鱲角的香港國際機場及東涌新市鎮與市區連接起來。 八十年代尾，政府決定於赤鱲角興建新機場及多項配套工程，組成機場核心計劃。 因為當時中方對機場核心計劃的做價﹝尤其對機場鐵路﹞與英方出現嚴重的分歧，引致英方要作出多項讓步後﹝包括機場鐵路由原來的四軌設計縮為雙軌設計﹞才能達成協議。但新機場及機場鐵路已無法在完定的九七年中啟用。
一九九六年三月，機場鐵路開始輔設路軌，稍後，連接香港及九龍站的沉管隧道的最後一節管道在海床完成沉放。九六年八月，機場鐵路首個車站完成平頂工程，該車站位於西九龍填海區北部大角咀上，此車站命名為奧運站以表揚香港奧運健兒。而在年尾，東涌站亦完成平頂工程。
一九九七年一月，荔景站平頂，而首部列車亦由西班牙運抵香港。二月二十八日機場鐵路藍巴勒海峽大橋結構工程完成。同年五月，青衣站平頂。九七年七月，首部工程車抵達香港站，象徵鐵路的路軌已由赤蠟角鋪設至香港島。九龍站亦於九月平頂。
機場鐵路工程進行了四十三個月後，香港站亦告竣工。東涌綫於一九九八年六月二十二日開始投入服務。而機場快綫則跟隨新機場的運作於七月六日啟用。
1990's 列車翻新工程
在一九九七年，地鐵將兩卡列車(A203/C203)的內部翻新，並行走各綫以收集乘客對列車的意見。稍後，地鐵正式批出翻新全綫列車合約。一九九八年未，首列完成翻新工程的列車正式投入服務。而有關工程亦已於二零零一年完成。
